Парсинг excel python pandas

Хотя многие Data Scientist’ы больше привыкли работать с CSV-файлами, на практике очень часто приходится сталкиваться с обычными Excel-таблицами. Поэтому сегодня мы расскажем, как читать Excel-файлы в Pandas, а также рассмотрим основные возможности Python-библиотеки OpenPyXL для чтения метаданных ячеек.

Дополнительные зависимости для возможности чтения Excel таблиц

Для чтения таблиц Excel в Pandas требуются дополнительные зависимости:

• xlrd поддерживает старые и новые форматы MS Excel [1];
• OpenPyXL поддерживает новые форматы MS Excel (.xlsx) [2];
• ODFpy поддерживает свободные форматы OpenDocument (.odf, .ods и .odt) [3];
• pyxlsb поддерживает бинарные MS Excel файлы (формат .xlsb) [4].

Мы рекомендуем установить только OpenPyXL, поскольку он нам пригодится в дальнейшем. Для этого в командной строке прописывается следующая операция:

pip install openpyxl

Затем в Pandas нужно указать путь к Excel-файлу и одну из установленных зависимостей. Python-код выглядит следующим образом:

import pandas as pd
pd.read_excel(io='temp1.xlsx', engine='openpyxl')
#
     Name  Age  Weight
0    Alex   35      87
1   Lesha   57      72
2  Nastya   21      64

Читаем несколько листов

Excel-файл может содержать несколько листов. В Pandas, чтобы прочитать конкретный лист, в аргументе нужно указать sheet_name. Можно указать список названий листов, тогда Pandas вернет словарь (dict) с объектами DataFrame:

dfs = pd.read_excel(io='temp1.xlsx',
                    engine='openpyxl',
                    sheet_name=['Sheet1', 'Sheet2'])
dfs
#
{'Sheet1':      Name  Age  Weight
 0    Alex   35      87
 1   Lesha   57      72
 2  Nastya   21      64,
 'Sheet2':     Name  Age  Weight
 0  Gosha   43      95
 1   Anna   24      65
 2   Lena   22      78}

Если таблицы в словаре имеют одинаковые атрибуты, то их можно объединить в один DataFrame. В Python это выглядит так:

pd.concat(dfs).reset_index(drop=True)
     Name  Age  Weight
0    Alex   35      87
1   Lesha   57      72
2  Nastya   21      64
3   Gosha   43      95
4    Anna   24      65
5    Lena   22      78

Указание диапазонов

Таблицы могут размещаться не в самом начале, а как, например, на рисунке ниже. Как видим, таблица располагается в диапазоне A:F.

Чтобы прочитать такую таблицу, нужно указать диапазон в аргументе usecols. Также дополнительно можно добавить header — номер заголовка таблицы, а также nrows — количество строк, которые нужно прочитать. В аргументе header всегда передается номер строки на единицу меньше, чем в Excel-файле, поскольку в Python индексация начинается с 0 (на рисунке это номер 5, тогда указываем 4):

pd.read_excel(io='temp1.xlsx',
              engine='openpyxl',
              usecols='D:F',
              header=4, # в excel это №5
              nrows=3)
#
    Name  Age  Weight
0  Gosha   43      95
1   Anna   24      65
2   Lena   22      78

Читаем таблицы в OpenPyXL

Pandas прочитывает только содержимое таблицы, но игнорирует метаданные: цвет заливки ячеек, примечания, стили таблицы и т.д. В таком случае пригодится библиотека OpenPyXL. Загрузка файлов осуществляется через функцию load_workbook, а к листам обращаться можно через квадратные скобки:

from openpyxl import load_workbook
wb = load_workbook('temp2.xlsx')
ws = wb['Лист1']
type(ws)
# openpyxl.worksheet.worksheet.Worksheet

Допустим, имеется Excel-файл с несколькими таблицами на листе (см. рисунок выше). Если бы мы использовали Pandas, то он бы выдал следующий результат:

pd.read_excel(io='temp2.xlsx',
              engine='openpyxl')
#
     Name  Age  Weight  Unnamed: 3 Name.1  Age.1  Weight.1
0    Alex   35      87         NaN  Tanya     25        66
1   Lesha   57      72         NaN  Gosha     43        77
2  Nastya   21      64         NaN  Tolya     32        54

Можно, конечно, заняться обработкой и привести таблицы в нормальный вид, а можно воспользоваться OpenPyXL, который хранит таблицу и его диапазон в словаре. Чтобы посмотреть этот словарь, нужно вызвать ws.tables.items. Вот так выглядит Python-код:

ws.tables.items()
wb = load_workbook('temp2.xlsx')
ws = wb['Лист1']
ws.tables.items()
#
[('Таблица1', 'A1:C4'), ('Таблица13', 'E1:G4')]

Обращаясь к каждому диапазону, можно проходить по каждой строке или столбцу, а внутри них – по каждой ячейке. Например, следующий код на Python таблицы объединяет строки в список, где первая строка уходит на заголовок, а затем преобразует их в DataFrame:

dfs = []
for table_name, value in ws.tables.items():
    table = ws[value]
    header, *body = [[cell.value for cell in row]
                      for row in table]
    df = pd.DataFrame(body, columns=header)
    dfs.append(df)

Если таблицы имеют одинаковые атрибуты, то их можно соединить в одну:

pd.concat(dfs)
#
     Name  Age  Weight
0    Alex   35      87
1   Lesha   57      72
2  Nastya   21      64
0   Tanya   25      66
1   Gosha   43      77
2   Tolya   32      54

Сохраняем метаданные таблицы

Как указано в коде выше, у ячейки OpenPyXL есть атрибут value, который хранит ее значение. Помимо value, можно получить тип ячейки (data_type), цвет заливки (fill), примечание (comment) и др.

Например, требуется сохранить данные о цвете ячеек. Для этого мы каждую ячейку с числами перезапишем в виде <значение,RGB>, где RGB — значение цвета в формате RGB (red, green, blue). Python-код выглядит следующим образом:

# _TYPES = {int:'n', float:'n', str:'s', bool:'b'}
data = []
for row in ws.rows:
    row_cells = []
    for cell in row:
        cell_value = cell.value
        if cell.data_type == 'n':
            cell_value = f"{cell_value},{cell.fill.fgColor.rgb}"
        row_cells.append(cell_value)
    data.append(row_cells)

Первым элементом списка является строка-заголовок, а все остальное уже значения таблицы:

pd.DataFrame(data[1:], columns=data[0])
#
     Name          Age       Weight
0    Alex  35,00000000  87,00000000
1   Lesha  57,00000000  72,FFFF0000
2  Nastya  21,FF00A933  64,00000000

Теперь представим атрибуты в виде индексов с помощью метода stack, а после разобьём все записи на значение и цвет методом str.split:

(pd.DataFrame(data[1:], columns=data[0])
 .set_index('Name')
 .stack()
 .str.split(',', expand=True)
)
#
                0         1
Name                       
Alex   Age     35  00000000
       Weight  87  00000000
Lesha  Age     57  00000000
       Weight  72  FFFF0000
Nastya Age     21  FF00A933
       Weight  64  0000000

Осталось только переименовать 0 и 1 на Value и Color, а также добавить атрибут Variable, который обозначит Вес и Возраст. Полный код на Python выглядит следующим образом:

(pd.DataFrame(data[1:], columns=data[0])
 .set_index('Name')
 .stack()
 .str.split(',', expand=True)
 .set_axis(['Value', 'Color'], axis=1)
 .rename_axis(index=['Name', 'Variable'])
 .reset_index()
)
#
     Name Variable Value     Color
0    Alex      Age    35  00000000
1    Alex   Weight    87  00000000
2   Lesha      Age    57  00000000
3   Lesha   Weight    72  FFFF0000
4  Nastya      Age    21  FF00A933
5  Nastya   Weight    64  00000000

Ещё больше подробностей о работе с таблицами в Pandas, а также их обработке на реальных примерах Data Science задач, вы узнаете на наших курсах по Python в лицензированном учебном центре обучения и повышения квалификации IT-специалистов в Москве.

Источники

1. https://xlrd.readthedocs.io/en/latest/
2. https://openpyxl.readthedocs.io/en/latest/
3. https://github.com/eea/odfpy
4. https://github.com/willtrnr/pyxlsb

Время на прочтение
5 мин

Количество просмотров 63K

Excel — это чрезвычайно распространённый инструмент для анализа данных. С ним легко научиться работать, есть он практически на каждом компьютере, а тот, кто его освоил, может с его помощью решать довольно сложные задачи. Python часто считают инструментом, возможности которого практически безграничны, но который освоить сложнее, чем Excel. Автор материала, перевод которого мы сегодня публикуем, хочет рассказать о решении с помощью Python трёх задач, которые обычно решают в Excel. Эта статья представляет собой нечто вроде введения в Python для тех, кто хорошо знает Excel.

Загрузка данных

Начнём с импорта Python-библиотеки pandas и с загрузки в датафреймы данных, которые хранятся на листах sales и states книги Excel. Такие же имена мы дадим и соответствующим датафреймам.

import pandas as pd
sales = pd.read_excel('https://github.com/datagy/mediumdata/raw/master/pythonexcel.xlsx', sheet_name = 'sales')
states = pd.read_excel('https://github.com/datagy/mediumdata/raw/master/pythonexcel.xlsx', sheet_name = 'states')

Теперь воспользуемся методом .head() датафрейма sales для того чтобы вывести элементы, находящиеся в начале датафрейма:

print(sales.head())

Сравним то, что будет выведено, с тем, что можно видеть в Excel.

Сравнение внешнего вида данных, выводимых в Excel, с внешним видом данных, выводимых из датафрейма pandas

Тут можно видеть, что результаты визуализации данных из датафрейма очень похожи на то, что можно видеть в Excel. Но тут имеются и некоторые очень важные различия:

• Нумерация строк в Excel начинается с 1, а в pandas номер (индекс) первой строки равняется 0.
• В Excel столбцы имеют буквенные обозначения, начинающиеся с буквы A, а в pandas названия столбцов соответствуют именам соответствующих переменных.

Продолжим исследование возможностей pandas, позволяющих решать задачи, которые обычно решают в Excel.

Реализация возможностей Excel-функции IF в Python

В Excel существует очень удобная функция IF, которая позволяет, например, записать что-либо в ячейку, основываясь на проверке того, что находится в другой ячейке. Предположим, нужно создать в Excel новый столбец, ячейки которого будут сообщать нам о том, превышают ли 500 значения, записанные в соответствующие ячейки столбца B. В Excel такому столбцу (в нашем случае это столбец E) можно назначить заголовок MoreThan500, записав соответствующий текст в ячейку E1. После этого, в ячейке E2, можно ввести следующее:

=IF([@Sales]>500, "Yes", "No")

Использование функции IF в Excel

Для того чтобы сделать то же самое с использованием pandas, можно воспользоваться списковым включением (list comprehension):

sales['MoreThan500'] = ['Yes' if x > 500 else 'No' for x in sales['Sales']]

Списковые включения в Python: если текущее значение больше 500 — в список попадает Yes, в противном случае — No

Списковые включения — это отличное средство для решения подобных задач, позволяющее упростить код за счёт уменьшения потребности в сложных конструкциях вида if/else. Ту же задачу можно решить и с помощью if/else, но предложенный подход экономит время и делает код немного чище. Подробности о списковых включениях можно найти здесь.

Реализация возможностей Excel-функции VLOOKUP в Python

В нашем наборе данных, на одном из листов Excel, есть названия городов, а на другом — названия штатов и провинций. Как узнать о том, где именно находится каждый город? Для этого подходит Excel-функция VLOOKUP, с помощью которой можно связать данные двух таблиц. Эта функция работает по принципу левого соединения, когда сохраняется каждая запись из набора данных, находящегося в левой части выражения. Применяя функцию VLOOKUP, мы предлагаем системе выполнить поиск определённого значения в заданном столбце указанного листа, а затем — вернуть значение, которое находится на заданное число столбцов правее найденного значения. Вот как это выглядит:

=VLOOKUP([@City],states,2,false)

Зададим на листе sales заголовок столбца F как State и воспользуемся функцией VLOOKUP для того чтобы заполнить ячейки этого столбца названиями штатов и провинций, в которых расположены города.

Использование функции VLOOKUP в Excel

В Python сделать то же самое можно, воспользовавшись методом merge из pandas. Он принимает два датафрейма и объединяет их. Для решения этой задачи нам понадобится следующий код:

sales = pd.merge(sales, states, how='left', on='City')

Разберём его:

1. Первый аргумент метода merge — это исходный датафрейм.
2. Второй аргумент — это датафрейм, в котором мы ищем значения.
3. Аргумент how указывает на то, как именно мы хотим соединить данные.
4. Аргумент on указывает на переменную, по которой нужно выполнить соединение (тут ещё можно использовать аргументы left_on и right_on, нужные в том случае, если интересующие нас данные в разных датафреймах названы по-разному).

Сводные таблицы

Сводные таблицы (Pivot Tables) — это одна из самых мощных возможностей Excel. Такие таблицы позволяют очень быстро извлекать ценные сведения из больших наборов данных. Создадим в Excel сводную таблицу, выводящую сведения о суммарных продажах по каждому городу.

Создание сводной таблицы в Excel

Как видите, для создания подобной таблицы достаточно перетащить поле City в раздел Rows, а поле Sales — в раздел Values. После этого Excel автоматически выведет суммарные продажи для каждого города.

Для того чтобы создать такую же сводную таблицу в pandas, нужно будет написать следующий код:

sales.pivot_table(index = 'City', values = 'Sales', aggfunc = 'sum')

Разберём его:

1. Здесь мы используем метод sales.pivot_table, сообщая pandas о том, что мы хотим создать сводную таблицу, основанную на датафрейме sales.
2. Аргумент index указывает на столбец, по которому мы хотим агрегировать данные.
3. Аргумент values указывает на то, какие значения мы собираемся агрегировать.
4. Аргумент aggfunc задаёт функцию, которую мы хотим использовать при обработке значений (тут ещё можно воспользоваться функциями mean, max, min и так далее).

Итоги

Из этого материала вы узнали о том, как импортировать Excel-данные в pandas, о том, как реализовать средствами Python и pandas возможности Excel-функций IF и VLOOKUP, а также о том, как воспроизвести средствами pandas функционал сводных таблиц Excel. Возможно, сейчас вы задаётесь вопросом о том, зачем вам пользоваться pandas, если то же самое можно сделать и в Excel. На этот вопрос нет однозначного ответа. Python позволяет создавать код, который поддаётся тонкой настройке и глубокому исследованию. Такой код можно использовать многократно. Средствами Python можно описывать очень сложные схемы анализа данных. А возможностей Excel, вероятно, достаточно лишь для менее масштабных исследований данных. Если вы до этого момента пользовались только Excel — рекомендую испытать Python и pandas, и узнать о том, что у вас из этого получится.

А какие инструменты вы используете для анализа данных?

Напоминаем, что у нас продолжается конкурс прогнозов, в котором можно выиграть новенький iPhone. Еще есть время ворваться в него, и сделать максимально точный прогноз по злободневным величинам.

Last updated on 
Jul 18, 2021

In this post you can learn how to read Excel files (ext xls, xlsx etc) with Python and Pandas. We will import one or several sheets from an Excel file to a Pandas DataFrame.

The list of the supported file extensions:

• xls
• xlsx
• xlsm
• xlsb
• odf
• ods
• odt

Note for ods, ods and odt please check: Read Excel(OpenDocument ODS) with Python Pandas

Step 1: Install Pandas and odfpy

Python offers many different modules for reading and manipulating Excel files. In this guide we are going to use pandas and odfpy:

pip install pandas
pip install odfpy

Step 2: Read the one sheet of Excel(XLS) file

Pandas offers a powerful method for reading any type of Excel files read_excel(). It’s pretty easy to be used and requires only the file path:

import pandas as pd

pd.read_excel('animals.xls')

It will read and return all non empty cells from the Excel file:

Step 3: Read the second sheet of Excel file by name

If you like to read data from a specific sheet — for example Sheet 2 then you can specify the name as a parameter — sheet_name:

pd.read_excel('animals.xlsx', sheet_name="Sheet2")

Which will result in:

Step 4: Python read excel file — specify columns and rows

If you like to read a range of data and not the whole sheet — read_excel offers several very useful parameters.

Python read excel file select rows

Next code example will show you how to read 3 rows skipping the first two rows. In this way Pandas will read only some rows from the whole sheet:

pd.read_excel('animals.xlsx', skiprows=2, nrows=3)

which will result in:

Python read excel file select columns

If you like to** work with few columns** and not the whole sheet — then parameter use_cols can be used as shown:

pd.read_excel('animals.xlsx', usecols='C:D')

Python read excel file specify columns and rows

Finally if you like to select a range from specific columns and rows than you can use:

Which will result into:

Step 5. Read multiple sheets from Excel file

What if you like to read with Pandas multiple sheets from Excel. It’s possible with pd.read_excel by providing a list of all sheets to be read as follows:

pd.read_excel('animals.xlsx', sheet_name=["Sheet1", "Sheet2"])

Note that a dictionary of

• keys — sheet names
• values — resulted DataFrames

will be returned.

In order to access data you can access it by a sheet name as:

pd.read_excel('animals.xlsx', sheet_name=["Sheet1", "Sheet2"]).get('Sheet1')

which will return the data for Sheet1 as a DataFrame.

Read All Sheets

For loading all sheets from Excel file use sheet_name=None:

pd.read_excel('animals.xlsx', sheet_name=None)

Step 6. Pandas read excel data with conversion, NA values and parsing

Finally let’s check what we can do if we need to convert data, drop or fill missing values, parse dates and numbers.

Pandas offers several parameters for this purpose:

• converters — dict of functions for converting values in certain columns
• keep_default_na — whether or not to include the default NaN values
• parse_dates
• ate_parser — converting a sequence of string columns to an array of datetime instances.
• thousands
• convert_float

You can check the Notebook in the resources for more examples of the above.

Resources

• Python Pandas Reading Excel files
• pandas.read_excel
• Notebook —
  Read Excel ODS with Python Pandas